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CHARACTERISTIC

技术特点

  • 极高通量

擅长大队列样本定量分析

  • 广泛适用

适用于各种样本,可分批送样

  • 准确性高

不依赖信号强度进行母离子挑选,为后续的生物信息学分析提供丰富的数据

  • 重复性好

使用内标校正肽段(iRT KIT)对不同样品的保留时间进行校正,适合珍贵样本

  • 注意事项

DIA定量蛋白质组需要DDA建库,16个样本以下需额外支付建库费用,dDIA定量蛋白质组无需建库


APPLICATIONS

应用方向

ADVANTAGES

服务优势

项目经验丰富

  • 项目经验涵盖多物种、多组织器官类型及多疾病类型,包括:

  • 100+种人类器官、组织、细胞及疾病类型;

  • 60+种小鼠器官、组织、细胞及疾病类型;

  • 60+种医学、农牧领域模式动物及非常见动物样本;

  • 60+种药物、农牧领域模式植物及非常见植物样本;

  • 60+种细菌、真菌等微生物样本。


项目文章丰富

与100+所医院、研究所等单位建立深度合作;

合作文章累积影响因子300+,发表于多部医学、生物学、植物等领域期刊。

服务选择多样

提供timsTOF HT、timsTOF Pro2、Orbitrap Astral、Orbitrap Exploris™ 480、Q Exactive HF-X、Orbitrap Eclipse等多种质谱平台选择;

提供DIA、dDIA、LFQ、TMT等多种定量方法选择。

  • 项目经验丰富

  • 项目文章丰富

  • 服务选择多样

MEASURED DATA

实测数据

青莲百奥3D定量蛋白质组实测数据

ANALYSIS PROCESS

分析流程

定量蛋白质组生信分析流程

RESULT DISPLAY

结果展示

定量蛋白质组结果展示

CLASSIC CASES

经典案例

合作文章|菟丝子与其寄主植物之间广泛的植物间蛋白质转移

发表期刊:Molecular Plant
影响因子:17.1
发表单位:中国科学院昆明植物研究所
发表时间:2019.12.05

查看详情
SAMPLE REQUIREMENTS

样本要求

样本类型送样量
动物组织常规组织(脑、心、肝、脾、肺、肾、肌肉等柔软组织)10 mg
坚硬组织(软骨、毛发)100 mg
植物组织柔软组织(木本植物的叶、花等,草本植物,藻类,蕨类植物)200 mg
坚硬组织(根、树皮、树枝,果实种子等)2 g
微生物常见细菌、真菌菌体(菌体沉淀)、精细胞30 μL
细胞悬浮/贴壁培养细胞(细胞计数/沉淀)2×106或20 μL
液体类血浆/血清(不去除高丰度)5 μL
血浆/血清(去除高丰度-伯乐)100 μL
血浆/血清(去除高丰度-TOP2/TOP14)50 μL
血浆/血清(去除高丰度-DMB蛋白冠)50 μL
脑脊液(不去除高丰度)100 μL
脑脊液(去除高丰度-TOP2/TOP14)300 μL
卵泡液(不去高丰度)100 μL
卵泡液(去除高丰度-伯乐)、尿液,精液1 mL
淋巴液、关节液、穿刺液、腹水3 mL
唾液/泪液/乳汁500 μL
培养基上清(不能使用含血清的培养基)5 mL
FFPE每片厚度10 μm,面积1.5×2 cm2-5片
其他蛋白溶液(最佳Buffer是8M Urea)10 μg


FAQ

常见问题

  • 全息扫描DIA技术原理是什么?

    传统的DDA技术依赖于一级质谱中母离子的峰强度选择信号强度排名在前几位的母离子进行二级质谱检测,DIA技术将质谱整个全扫描范围分为若干个窗口,对每个窗口中的所有离子进行选择、碎裂、检测,从而无遗漏、无差异地获得样本中所有离子的全部碎片信息。


  • 为什么DIA需要先进行建库?

    DIA的全扫描方式获得的数据过于复杂,其每张二级谱图中混合了来自于多个一级信号的信息,通常难以直接进行理论库匹配,一般需要先进行DDA建库辅助对DIA数据进行高效、准确地解析。

    不过随着机器深度学习技术的发展,目前spectronaut搜库软件支持DIA数据直接搜库,检出数据已达到与传统的建库方法相近的水平。

  • DIA适用于什么类型的实验设计?

    DIA是全息扫描模式,能全面记录样本信息,定量准确性大大提高,重复性好,缺失值少,样本采集时加入了保留时间校正同位素肽段,适合大队列样本,上机时间间隔可以较大,可分批送样,数据可回溯。

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