全称Protein-protein interaction(蛋⽩质-蛋⽩质相互作⽤)。
指两个或两个以上的蛋⽩质分⼦通过⾮共价键形成蛋⽩质复合体的过程。
全称Foldchange(差异倍数)。说明蛋⽩表达变化是否显著。
先⽤蛋⽩酶把蛋⽩序列进⾏酶切,再针对酶切后的肽段进⾏鉴定,所以进⼊质谱的检测对象永远是肽段,再根据肽段序列再推导出蛋⽩序列,也就是我们常说的shotgun⽅法
是指从⼀个完整的蛋⽩出发,在质谱中进⾏碎⽚化处理,通过对碎⽚分⼦的检测,推导出蛋⽩的序列。
可变修饰是指这种修饰不是稳定存在,不是所有肽段都存在的,有可能是可逆修饰,也有可能化学修饰发⽣的概率不是100%等等。
是指所有肽段上都稳定存在的⼀种修饰,⼀般是添加烷基化修饰,是在样本制备过程中⼈为加进去的化学反应,使所有肽段都发⽣了这个修饰。
全称Peptide-Spectrum matching(匹配到的谱图数)。指将实际采集到的谱图与理论谱图库进⾏⽐对,当实际谱图能匹配上肽段时,则记作⼀张PSM。