检测通量
一次性检测6-18个样本，大队列样本需每批加入1-2个相同样本作为内参；
适用范围
擅长复杂样本定量分析，不适用于不同组织器官类型样本混合检测；
重复性好
所有样本混合上机，同时进行质谱检测；
缺失值少
为后续生物信息学分析提供丰富的数据；
注意事项
具有比值压缩效应，蛋白质差异倍数有一定程度压缩。
临床大队列样本的疾病分型、生物标志物发现；生理、病理及感染免疫的机制研究；药物的研发与药效评估
动植物的生长发育、遗传育种及生态保护研究；生物对环境的适应及胁迫抗逆的机制研究；营养与饲料成分的分析与优化
食品营养价值与品质的分析鉴定；产品成分的分析与优化；食品安全的提升
提供timsTOF HT、timsTOF Pro2、Orbitrap Astral、Orbitrap Exploris™ 480、Q Exactive HF-X、Orbitrap Eclipse等多种质谱平台选择；
提供DIA、dDIA、LFQ、TMT等多种定量方法选择。
项目经验涵盖多物种、多组织器官类型及多疾病类型，包括：
100+种人类器官、组织、细胞及疾病类型；
60+种小鼠器官、组织、细胞及疾病类型；
60+种医学、农牧领域模式动物及非常见动物样本；
60+种药物、农牧领域模式植物及非常见植物样本；
60+种细菌、真菌等微生物样本。
与100+所医院、研究所等单位建立深度合作；
合作文章累积影响因子300+，发表于多部医学、生物学、植物等领域期刊。
发表期刊：Molecular Plant
影响因子：17.1
发表单位：中国科学院昆明植物研究所
发表时间：2019.12.05
| 样本类型 | 送样量 | |
| 动物组织 | 常规组织（脑、心、肝、脾、肺、肾、肌肉等柔软组织） | 20 mg |
| 坚硬组织（软骨、毛发） | 200 mg | |
| 植物组织 | 柔软组织（木本植物的叶、花等，草本植物，藻类，蕨类植物） | 300 mg |
| 坚硬组织（根、树皮、树枝，果实种子等） | 3 g | |
| 微生物 | 常见细菌、真菌菌体（菌体沉淀）、精细胞 | 50 μL |
| 细胞 | 悬浮/贴壁培养细胞（细胞计数/沉淀） | 5×106或20 μL |
| 液体类 | 血浆/血清（不去除高丰度） | 10 μL |
| 血浆/血清（去除高丰度-伯乐） | 300 μL | |
| 血浆/血清（去除高丰度-TOP2/TOP14） | 50 μL | |
| 脑脊液（不去除高丰度） | 200 μL | |
| 脑脊液(去除高丰度-TOP2/TOP14) | 500 μL | |
| 卵泡液（不去高丰度） | 200 μL | |
| 卵泡液（去除高丰度-伯乐）、尿液，精液 | 2 mL | |
| 淋巴液、关节液、穿刺液、腹水 | 5 mL | |
| 唾液/泪液/乳汁 | 1 mL | |
| 培养基上清（不能使用含血清的培养基） | 10 mL | |
| FFPE | 每片厚度10 μm，面积1.5×2 cm | 10-15片 |
| 其他 | 蛋白溶液（最佳Buffer是8M Urea） | 30 μg |
TMT适用于相同组织的相对定量分析，不能进行有或无的鉴定，不能将不同的组织部位一起标记上机，不能将不用物种的样本一起上机，对蛋白总量需求较LFQ高。
TMT试剂标签之间的质量差额在0.006 Da左右，需要质谱二级分辨率在50k以上才能准确分辨出不同的报告离子，因此只有在高分辨质谱仪上才能完成标记定量实验。主流仪器有Thermo fisher公司的 orbitrap系列质谱仪。
Thermo Scientific 串联质谱标签试剂Tandem Mass Tag（TMT） reagents专为通过串联质谱对不同样品中的蛋白质进行鉴定和定量而设计。一组标签试剂里的所有标签均带有相同的质量，由一个胺反应性的NHS 酯基团，间隔臂（质量调整区）和质量报告基团组成。
平行反应监测（PRM）能够对目标蛋白质或肽段进行选择性检测，不受抗体与种属限制，是质谱界的Western blot
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