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CHARACTERISTIC

技术特点

宏基因组学(Metagenomics)又名元基因组,鸟枪法宏基因组测序,绕过对微生物个体进行分离培养,应用基因组学技术对环境中全部微生物的群落组成及群落功能进行研究。

通过宏基因组学测序可以获得微生物体系群落组成、微生物和宿主的相互作用、难分离培养菌株的基因组序列、不同处理对物种和基因的影响以及功能基因及其丰度信息。

APPLICATIONS

应用方向

ADVANTAGES

服务优势

微生物组提取经验丰富

百余种不同环境样品,包括:粪便、肠道内容物、饲料、长粘膜、酒曲、土壤、瘤胃液、植物内生菌、牙菌斑、发酵液等

测序建库经验丰富

针对不同样本类型,采用不同的提取方法,使用illumina原装进口建库试剂盒

数据产出均一

定量严格,数据产出均一性优

分析内容丰富全面

①基础分析
②常规分析:物种组成、Alpha和Beta多样性分析、基因预测及功能注释、功能注释丰度分析、物种注释丰度分析
③高级分析:宏基因组关键生物标志物筛选
④个性化分析:VFDB病原菌毒力因子注释、ARDB耐药基因注释、CARD抗性基因注释等(宏基因组)

  • 微生物组提取经验丰富

  • 测序建库经验丰富

  • 数据产出均一

  • 分析内容丰富全面

ANALYSIS PROCESS

分析流程

微生物组学生信分析流程

RESULT DISPLAY

结果展示

微生物组学结果展示

CLASSIC CASES

经典案例

肥胖丰富的肠道微生物会降解肌醇并促进脂质吸收

发表期刊:Cell Host Microbe
影响因子:20.6
发表单位:海交通大学医学院附属瑞金医院
发表时间:2024.07.11

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SAMPLE REQUIREMENTS

样本要求

样本类型16S rRNA宏基因组
粪便0.5g

1g

肠道内容物0.5g

1g

肠道组织1g2g
唾液2-4mL5-10mL
生殖道样本

刮片3片

棉拭子 3份

刮片3片

棉拭子 3份

固体类食品60g60g
液体类食品50mL50mL
土壤2-5g2-5g
植物内生菌

≥20个贴片、卷片组织

≥1.5g石蜡块

≥20个贴片、卷片组织

≥1.5g石蜡块

水样滤膜直径3-5cm,3-5张直径3-5cm,3-5张


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