2023年8月,青莲百奥CTO赵焱博士与中国人民解放军总 医院合作的血浆蛋白质组最新成果发表于《Analytica Chimica Acta》。该研究利用DMB磁珠富集47例临床血浆 低丰度蛋白质。通过血浆蛋白质组鉴定出18种与神经系 统疾病相关或脑组织特异性表达的差异蛋白,并交叉验证 了ENPP2和SLC2A1/Glut1蛋白的ELISA结果,证明了临 床生物标志物研究的可行性。
设计了一系列实验来评估该策略的有效性:
DMB磁珠富集与传统富集方法的定性深度和重现性比较:高丰度蛋白去除(2种和14种)、六肽配体富集和DMB磁珠富集处理,比较定量结果;
血浆和DMB磁珠不同孵育时间和消化方法的比较:不同时间(0.5、1、2和4小时)孵育,比较定量结果
不同血浆加入体积富集结果比较:不同体积的血浆样品加入等体积的DMB磁珠中进行富集,比较定量结果
定量结果可靠性评价:向等量的血浆中添加不同梯度的大肠杆菌蛋白混合物,检测大肠杆菌蛋白和血浆蛋白
采用该策略分析了来自MSA组和健康对照组(MSA患者n=18;健康对照n = 18)的血浆样本。
该研究的血浆深度挖掘策略提高了血浆蛋白质组的检测深度,同时在样品富集方面具有良好的稳定性,同时在节省时间和减少损失方面具有一定优势。将该策略应用于MSA疾病标志物发现中,鉴定出18种与神经系统疾病相关或脑组织特异性表达的差异蛋白,并交叉验证了ENPP2和SLC2A1/Glut1蛋白的ELISA结果,证明了临床生物标志物研究的可行性。