⾊谱法是⼀种分离技术，试样混合物的分离过程也就是试样中各组分在称之为⾊谱分离柱中的两相间不断进⾏着的分配过程。其中的⼀相固定不动，称为固定相；另⼀相是携带试样混合物流过此固定相的流体（⽓体或液体），称为流动相。当流动相中携带的混合物流经固定相时，其与固定相发⽣相互作⽤。由于混合物中各组分在性质和结构上的差异，与固定相之间产⽣的作⽤⼒的⼤⼩、强弱不同，随着流动相的移动，混合物在两相间经过反复多次的分配平衡，使得各组分被固定相保留的时间不同，从⽽按⼀定次序由固定相中流出。与适当的柱后检测⽅法结合，实现混合物中各组分的分离与检测。
⾼效液相⾊谱法(HPLC)是⽬前应⽤⼴泛的分离、分析、纯化有机化合物(包括能通过化学反应转变为有机化合物的⽆机物)的有效⽅法之⼀。在已知的有机化合物中，约有80%能⽤⾼效液相⾊谱法分离、分析，⽽且此法条件温和，不破坏样品，因此特别适合⾼沸点、难⽓化挥发、热稳定性差的有机化合物和⽣命物质。
Q ExactiveTM组合型四级杆Orbitrap；Q ExactiveTMHF组合型四级杆Orbitrap；Orbitrap FusionTMTribridTM；Orbitrap FusionTMLumosTMTribridTM三合⼀。
不同的质谱仪主要差别在于质量范围和分辨率的不同，三合⼀和⼆合⼀质谱，各有各的特点，摸索合适的采集⽅法，都能获得较好质量的数据。
基质辅助激光解析串联⻜⾏时间质谱仪，Time of Flight Mass Spectrometer(TOF)是⼀种很常⽤的质谱仪。离⼦经过加速后获得统⼀的动能，并进⼊⽆场漂移管中恒定速度⻜⾏，因此离⼦质量越⼤，到达接收器所⽤时间越⻓，离⼦质量越⼩，到达接收器所⽤时间越短，根据这⼀原理，可以通过检测⻜⾏时间⽽判断离⼦的m/z值。此类质谱仪没有分析系统，适合于较为简单的样本。⽬前⼀般适⽤于：纯蛋⽩分⼦量测定、胶点蛋⽩鉴定。
HPLC-MS/MS⾼效液相⾊谱-质谱联⽤技术，液相⾊谱作为分离技术，质谱作为检测系统，分离的肽段进⼊质谱进⾏离⼦碎⽚化；经过质谱质量分析器检测器得到谱图；谱图信息经过⽣物信息统计分析，得到谱图的注释信息，完成对样本的定性分析。
液质联⽤的优势即液相对复杂样品的⾼分离能⼒与质谱的⾼选择性、⾼灵敏性相结合。
单⼀蛋⽩鉴定；混合蛋⽩鉴定；Label-Free组学分析；TMT/iTRAQ组学分析；磷酸化蛋⽩组学分析；泛素化/甲基化/⼄酰化/糖基化蛋⽩组学分析；宏蛋⽩组学分析；DIA全息扫描；PRM靶向蛋⽩组学；外泌体蛋⽩组学、FFPE、O/N-糖基化。
SDS-聚丙烯酰胺胶电泳，是在聚丙烯酰胺凝胶系统中引进SDS，SDS能断裂分⼦内和分⼦间氢键，破坏蛋⽩质的⼆级和三级结构，强还原剂能使半胱氨酸之间的⼆硫键断裂，蛋⽩质在⼀定浓度的含有强还原剂的SDS溶液中，与SDS分⼦按⽐例结合，形成带负电荷的SDS-蛋⽩质复合物，这种复合物由于结合⼤量的SDS，使蛋⽩质丧失了原有的电荷状态形成仅保持原有分⼦⼤⼩为特征的负离⼦团块，从⽽降低或消除了各种蛋⽩质分⼦之间天然的电荷差异，由于SDS与蛋⽩质的结合是按重量成⽐例的，因此在进⾏电泳时，蛋⽩质分⼦的迁移速度取决于分⼦⼤⼩。
